世界はヒーローを必要としていた。そして、ハリネズミが現れた。スピードと行動力にあふれたスーパーパワーを持つソニック（ベン・シュワルツ）と仲間たちが、この壮大な2部作の冒険でチームを組み、世界を救い、悪の天才ドクター・ロボトニック（ジム・キャリー）の世界征服計画を阻止する。最初の冒険では、ソニックと新しい親友トム（ジェームズ・マースデン）がタッグを組んで地球とソニックの唯一無二のスーパーパワーを守る。次のレベルの冒険では、ソニックは真のヒーローになるために必要なものがあることを証明しようと躍起になる。彼は相棒のテイルス（コリーン…）とチームを組み、パンチの強い新エキドナ、ナックルズ（イドリス・エルバ）と手を組んだドクター・ロボトニックを倒すため、世界中を駆け巡る冒険に出る。