マイルズ・モラレスが、アカデミー賞®受賞作品『スパイダーバース』サーガ（2018年、長編アニメーション映画賞受賞）の次なる章、『スパイダーマン™：アクロス・ザ・スパイダーバース』に帰ってくる。ブルックリンの心優しい隣人スパイダーマンは、グウェン・ステイシーとの再会後、マルチバースの世界に飛ばされ、その存在そのものを守る任務を負ったスパイダーマンのチームと出会う。しかし、ヒーローたちが新たな脅威への対処法を巡って衝突する中、マイルズは他のスパイダーたちと対峙することになり、愛する人々を救うためにヒーローとは何かを再定義しなければならない。