盗まれたプルトニウムを回収するという危険な任務に就いたイーサン・ハント（トム・クルーズ）は、任務遂行よりもチームを救う道を選び、文明を滅ぼそうと企む高度なスキルを持つ工作員たちの手に核兵器が渡ってしまう事態を招いてしまう。世界が危機に瀕する中、イーサンとIMFチーム（サイモン・ペッグ、ヴィング・レイムス、レベッカ・ファーガソン）は、核の降下物を食い止めるため、時間との闘いの中で、不本意ながらもCIAエージェント（ヘンリー・カヴィル）と手を組むことになる。これほど破壊的な脅威はかつてなく、映画の中のスタントは息を呑むほど素晴らしく、批評家たちは「史上最高のミッション！」と絶賛している（エリック・デイヴィス、『ファンダンゴ』）。