「ペット2」は、ペットたちの心情、ペットたちとの深い絆、ペットを愛する家族を探求し、「飼い主がいないとき、あなたのペットたちは本当は何をしているのか？」という問いに答えます。テリアのマックス（パット・オズワルド）は、ケイティの結婚と幼児の誕生で、人生の大きな変化に立ち向かっています。一方、ギジェット（ジェニー・スレイト）は、キャットニップの楽しさを発見した猫の友達クロエ（レイク・ベル）の助けを借りて、猫だらけのアパートからマックスのお気に入りのおもちゃを救出しようと奮闘します。そしてスノーボール（ケヴィン・ハート）は、飼い主がスーパーヒーローのパジャマを着せ始めてから、自分がスーパーヒーローだと妄想してしまいます。しかし、恐れを知らぬシーズー犬のデイジー（ティファニー・ハディッシュ）が、スノーボールに危険な任務への協力を求めに現れたことで、スノーボールは勇気を奮い起こし、自分が偽ってきたヒーローにならなければなりません。マックス、スノーボール、ギジェット、そして仲間たちは、最大の恐怖に立ち向かう内なる勇気を見つけることができるでしょうか?