スパイダーマン（アンドリュー・ガーフィールド）であることは素晴らしい。ピーター・パーカーにとって、高層ビルの間を飛び回り、ヒーローであることを謳歌し、グウェン（エマ・ストーン）と過ごすことほど素晴らしい喜びはない。しかし、スパイダーマンであることには代償が伴う。街を脅かす恐るべきヴィランから仲間のニューヨーカーたちを守れるのは、スパイダーマンだけなのだ。エレクトロ（ジェイミー・フォックス）の出現により、ピーターは自身よりもはるかに強力な敵に立ち向かわなければならない。そして、旧友のハリー・オズボーン（デイン・デハーン）が戻ってきたことで、ピーターはすべての敵に共通点があることに気づく。オズコープ社だ。